Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2RAP15509 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms