Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms