Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms