Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms