Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSI1O43347 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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MSI1O43347 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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