Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.6 ms