Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBAG9O00559 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms