Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PTAR1-201ENST00000340434 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms