Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms