Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP16Q9Y5T5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms