Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP15Q9Y4E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms