Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIT1Q9Y3P8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIT1Q9Y3P8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIT1Q9Y3P8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIT1Q9Y3P8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIT1Q9Y3P8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms