Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCA2Q9UQC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms