Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms