Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FZD1Q9UP38 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms