Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms