Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms