Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
ZNF608Q9ULD9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ZNF608Q9ULD9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms