Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP45Q9UL16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP45Q9UL16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP45Q9UL16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms