Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAV3Q9UKW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAV3Q9UKW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms