Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAD8Q9UKU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAD8Q9UKU7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms