Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms