Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms