Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIX4Q9UIU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms