Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NPC1L1Q9UHC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPC1L1Q9UHC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms