Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRDQ9UH36 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRRDQ9UH36 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms