Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3BQ9UH17 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms