Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM8A1Q9UBU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms