Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE7Q9UBL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms