Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPR1Q9UBH6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms