Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL13Q9P2N7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms