Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCNT4Q9P109 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT4Q9P109 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms