Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC10Q9NYD6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms