Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOR4AQ9NXH8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR4AQ9NXH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms