Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMPD4Q9NXE4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD4Q9NXE4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms