Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYARQ9NX58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYARQ9NX58 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms