Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM248Q9NWD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM248Q9NWD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms