Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39AQ9NV64 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
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