Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCC13Q9NSE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCC13Q9NSE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC13Q9NSE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC13Q9NSE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC13Q9NSE7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC13Q9NSE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC13Q9NSE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC13Q9NSE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms