Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms