Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM1Q9NRU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM1Q9NRU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms