Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 311.07□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 425.1■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 523.48■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 221.8■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 421.38■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 PHF1-209ENST00000487667 1930 ntTSL 530.63■■■□□ 2.494e-7■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 SLC25A43-204ENST00000493093 896 ntTSL 331.43■■■□□ 2.622e-9■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A43-203ENST00000488158 2699 ntTSL 226.79■■□□□ 1.882e-9■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.572e-9■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A43-202ENST00000484058 358 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.275e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FN3KRP-207ENST00000574832 1422 ntTSL 229.03■■■□□ 2.245e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FN3KRP-206ENST00000574356 887 ntTSL 528.76■■■□□ 2.25e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FN3KRP-204ENST00000573158 627 ntTSL 325.47■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FN3KRP-205ENST00000574206 683 ntTSL 325.14■■□□□ 1.615e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FN3KRP-209ENST00000577128 515 ntTSL 520.56■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-209ENST00000424419 1276 ntTSL 232.4■■■□□ 2.781e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.541e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-206ENST00000372669 1005 ntTSL 520.28■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-216ENST00000467203 943 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-211ENST00000427410 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-207ENST00000414185 677 ntTSL 315.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-212ENST00000440226 1717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-201ENST00000308733 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-213ENST00000447388 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-203ENST00000372652 2363 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-208ENST00000416859 547 ntTSL 512.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 NFYC-220ENST00000525290 433 ntTSL 58.5□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 31.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-219ENST00000545245 709 ntTSL 425.47■■□□□ 1.671e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.611e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 RPS27L-206ENST00000482846 2944 ntTSL 1 (best)21.73■■□□□ 1.071e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 FADS1-220ENST00000545405 582 ntTSL 221.45■■□□□ 1.021e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 FADS1-212ENST00000539419 563 ntTSL 418.64■□□□□ 0.571e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.11e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.453e-7■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 350.81■■■■■ 5.722e-8■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)25.64■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 31.5
DROSHAQ9NRR4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 31.4
DROSHAQ9NRR4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 336.54■■■■□ 3.446e-10■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-217ENST00000479161 942 ntTSL 523.88■■□□□ 1.416e-10■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-221ENST00000489562 646 ntTSL 221.25■□□□□ 0.996e-10■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 KPNB1-214ENST00000583648 896 ntTSL 422.5■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-208ENST00000537354 450 ntTSL 317.9■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB1-205ENST00000556818 453 ntTSL 428.85■■■□□ 2.218e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB1-202ENST00000553583 582 ntTSL 323.61■■□□□ 1.378e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.118e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB1-206ENST00000556965 509 ntTSL 44.52□□□□□ -1.698e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.23■■■■■ 4.993e-7■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-222ENST00000479679 894 ntTSL 237.03■■■■□ 3.523e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-219ENST00000471707 745 ntTSL 526.11■■□□□ 1.773e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 531.13■■■□□ 2.572e-8■■■■■ 31.3
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.263e-6■■■■■ 31.1
DROSHAQ9NRR4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 31.1
DROSHAQ9NRR4 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 31.1
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.983e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 325.43■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 223.2■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 420.97■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 320.23■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 517.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 417.91■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-213ENST00000573659 578 ntTSL 416.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 414.98□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 49.86□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 TPST2-205ENST00000442495 586 ntTSL 233.81■■■■□ 33e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.833e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 TPST2-207ENST00000450022 544 ntTSL 331.69■■■□□ 2.663e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 TPST2-204ENST00000440953 544 ntTSL 528.03■■■□□ 2.083e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.891e-6■■■■■ 30.9
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.262e-11■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.852e-11■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-11■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.344e-9■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 LRMDA-201ENST00000372499 899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 30.8
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