Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
OTORQ9NRC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTORQ9NRC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms