Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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