Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC4Q9NPG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC4Q9NPG8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms