Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD3Q9NPG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms