Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC24A3Q9HC58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A3Q9HC58 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms