Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDFQ9HBH1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms