Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms