Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms